Leta 1996 je svojo pot nadaljeval kot specializant interne medicine ter se hkrati vpisal na magistrski študij. Del podiplomskega izobraževanja je preživel v ZDA, na priznani Univerzi v Ann Arborju (Michigan).

Po specializaciji se je zaposlil v UKC Ljubljana, na Oddelku za revmatologijo v bolnišnici dr. Petra Držaja.  Tam je ostal vse do upokojitve leta 2018.

Z Medicinskim centrom Artros sodeluje že več kot petnajst let. Opravlja specialistične preglede ter po postavljeni diagnozi bolnike usmerja k ustreznemu zdravljenju. V ambulanti izvaja tudi enostavnejše posege, kot so infiltracije z glukokortikoidi.

Njegovi pacienti še posebej cenijo poglobljen pristop in prizadevanje za celostno razumevanje njihovih težav. Kot navdušen rekreativni kolesar, plavalec in tekač revmatolog mag. Boris Letan pogosto poudarja pomen rednega gibanja in ga spodbuja tudi pri svojih pacientih, saj verjame, da ohranjanje gibljivosti sklepov pomembno prispeva h kakovostnemu življenju v vseh starostnih obdobjih.